現在の御学問所は、紫宸殿(ししんでん)や清涼殿(せいりょうでん)と同じく、安政２年(1855)に建てられ、小御所(こごしょ)の北側、御常御殿(おつねごてん)の西南に位置します。御殿内はすべて畳敷きで、6室の部屋があり、西側は廊下が接し、それ以外の三方には御縁座敷が設けられています。この御殿は、床(とこ)や違棚(ちがいだな)、明かり障子、遣戸、畳が用いられるなど書院造の特徴が見られます。
